Фамилия Сахоненко относится к распространенному типу украинских фамилий и образована от имени Сахон. Имя Сахон является краткой формой мужского крестильного имени Александр, которое в переводе с греческого языка означает «мужественный». Поэтому Сахоненко буквально понималось как «сын Сахона».