Фамилия Саманина — женская форма, а её мужской вариант — Саманин. В основе лежит либо имя, либо прозвище, и здесь есть два равноправных объяснения, оба с опорой на реальные древнерусские слова.

Первая и самая прямая версия: отчество от имени Саманя. Это уменьшительная форма от канонического имени Самуил (древнееврейское «услышанный Богом»). В народной речи имя Самуил давало множество производных: Самуха, Самаха, Самоха, а также Саманя. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Саманин, то есть сын Самани. Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, оканчивающихся на -а или -я.

Вторая версия, не менее вероятная, связывает фамилию с прозвищем Саманя. В русских говорах «саманя» — это не просто имя, а прозвище самостоятельного, независимого человека. Слово «сам» в значении «хозяин, глава, самостоятельный» дало множество прозвищ: Сам, Сама, Саманя. Так могли назвать того, кто «сам себе голова», не терпел опеки, жил своим умом. Фамилии от таких прозвищ встречаются повсеместно, и они часто сосуществуют с фамилиями от церковных имён.

Интересная деталь: фамилия Саманин зафиксирована в старых актах. В Переславль-Залесском уезде в начале XVII века упоминается крестьянин Саманин, а в Воронежских писцовых книгах 1615 года — помещик Иван Саманин. Это показывает, что фамилия бытовала в разных слоях общества и не была привязана к одной местности.

Сравните с однокоренными фамилиями: Самарин, Самохин, Самуйлов. Самарин, кстати, тоже может идти от имени Самаря или от слова «самара» (длиннополая одежда), но с Саманиным такого пересечения нет — его корень однозначно связан с «сам» или «Самуил». По написанию фамилия Саманина встречается реже, чем Самарина, и это делает её более редкой и локальной.

Если ваши предки носили фамилию Саманина, скорее всего, родоначальника звали Саманя — либо по имени Самуил в уменьшительной форме, либо по прозвищу за самостоятельный характер. Оба варианта укладываются в типичную русскую ономастику.