Фамилия Самарная — редкий случай, когда географическое название и род занятий могли слиться воедино. В основе фамилии лежит слово «самар» или «самара». Самое прямое объяснение — связь с рекой Самарой (левым притоком Волги) или с городом Самара. Житель тех мест, переселенец с берегов Самары мог получить прозвище Самарный, то есть «самарский». Однако фамилия образована не по типичной модели на -ский/-цкий, а с помощью суффикса -н-, что указывает на иной путь.

Скорее всего, исходным было не географическое, а профессиональное прозвище. В южнорусских и украинских говорах «самар» — это название растения, дикого чеснока, а также «самарка» — сорт груши. Человек, торговавший диким чесноком или грушами, мог получить прозвище Самарный. Но есть и другая, более весомая версия. В донских и кубанских говорах «самара» — это длинный кафтан, халат, а также мешковина, грубая ткань. Человека, носившего такую одежду или шившего её, могли прозвать Самарой. Отсюда Самарный — тот, кто имеет отношение к самаре: портной, торгаш или просто обладатель характерной верхней одежды.

Суффикс -н-ой (под ударением) в фамилии Самарная — это притяжательная форма женского рода. В русской традиции фамилии на -ой закрепились в южных и центральных областях России. Первоначально так отвечали на вопрос «чей?»: Самарная — дочь или жена Самарного. Со временем форма застыла и перешла в разряд фамилий, передаваемых по наследству. Встречается она преимущественно в Курской, Белгородской, Воронежской областях и на юге Украины — как раз там, где слово «самара» в значении «одежда» или «растение» было в ходу.

Фамилия Самарная не имеет отношения к слову «самовар» или к чему-то «самому главному». Её корень конкретен и материален: либо река, либо растение, либо грубая ткань. И если первая версия красива, то вторая — правдоподобнее, ведь прозвища по одежде и ремеслу давали на Руси повсеместно.