Фамилия Самоненко звучит как типичная украинская фамилия, и это первое, что бросается в глаза. Её выдали суффикс и окончание: модель «-енко» в украинской ономастике — одна из самых распространённых, она указывает на родство по отцу. Буквально Самоненко — это «сын Самона», и такой способ образования фамилий закрепился в народной речи примерно с XV–XVII веков, когда отчество постепенно превращалось в наследственное семейное имя.

В основе фамилии лежит крестильное имя Самон. Оно пришло на Русь вместе с христианством и имеет древнееврейские корни. В переводе с иврита это имя означает «крепкий», «сильный». В православных святцах почитается мученик Самон, пострадавший за веру в IV веке, поэтому имя было знакомо нашим предкам и встречалось в крестьянской и посадской среде. Однако в народе его нередко путали с более привычным библейским Симоном или с греческим именем Симон, что порождало варианты написания и произношения.

Интересно, что от имени Самон образовалось сразу несколько родственных фамилий, и Самоненко — лишь одна из них. В украинской традиции параллельно бытовали формы Самонов, Самонюк, Самончук. Разница между ними — в региональных предпочтениях: суффикс «-енко» чаще встречался на Левобережной Украине, тогда как «-ук» и «-чук» тяготели к Западной Украине и Полесью. Таким образом, носитель фамилии Самоненко, скорее всего, имеет предков из центральной или восточной части Украины.

Если говорить о социальном контексте, то фамилии на «-енко» не были привилегией знати. Их носили казаки, мещане, крестьяне и духовенство. Поэтому Самоненко — это фамилия, которая не указывает на сословие, а лишь говорит о том, что предок носителя был человеком по имени Самон, возможно, отличавшимся крепким телосложением или твёрдым характером — в соответствии со значением имени.

В написании фамилии иногда встречается путаница: её путают с фамилией Семененко, образованной от имени Семён. Это неудивительно, ведь в разговорной речи звуки «а» и «е» в безударной позиции почти не различаются. Но этимологически это разные фамилии, и корень у них разный: у Самоненко — древнееврейский «крепкий», у Семененко — греческий «услышанный Богом».