Основой фамилии Самонов послужило церковное имя Самон. Фамилия Самонов ведет свое начало от редкого крестильного мужского имени Самон. Оно имеет еврейское происхождение и переводится на русский язык как «крепкий». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Самон, со временем получил фамилию Самонов.