Фамилия Самошко — яркий пример того, как одна буква в суффиксе меняет «национальность» фамилии. Если бы она оканчивалась на -ов, мы бы без колебаний отнесли её к русским. Но суффикс -ко — верный признак украинского или белорусского происхождения. В ономастике такие фамилии называют «типично малороссийскими»: они массово формировались в XVI–XVII веках на землях Речи Посполитой и Гетманщины, а суффикс -ко выполнял роль уменьшительно-ласкательного или патронимического (указывал на родство по отцу).

Основа фамилии — имя или прозвище Самош. Это краткая форма от православного имени Самуил (древнееврейское «услышанный Богом»). В народной речи имя Самуил сокращалось до Самойло, а от него — до ласкательных Самоша и Самош. Таким образом, Самошко — это «маленький Самош» или, что вероятнее, «сын Самоша» (украинский аналог русского отчества на -ов). В пользу этой версии говорит и то, что в украинских реестрах XVII века встречаются и Самошенко, и Самошко — однокоренные варианты одного патронима.

Вторая, менее распространённая гипотеза связывает фамилию не с именем, а с прозвищем. В некоторых говорах «самош» или «самошка» могли называть человека самостоятельного, себе на уме, или, наоборот, того, кто всё делает сам, без помощников. Однако эта версия слабее: прозвище Самош не зафиксировано в исторических документах как самостоятельное, в отличие от имени Самуил.

Географически фамилия Самошко тяготеет к западным и центральным областям Украины, а также к югу Беларуси. В дореволюционных переписях носители фамилии чаще всего числились мещанами или казаками — ремесленниками и мелкими торговцами, а не крепостными крестьянами. Это косвенно указывает на то, что предки Самошко, скорее всего, жили в городах или местечках, где фамилии закреплялись раньше и быстрее, чем в деревне.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: корень Самош- плюс типичный украинский суффикс -к- (с окончанием -о). Ударение, скорее всего, падает на второй слог — Само́шко, хотя в разных семьях могло закрепиться и на первом: Са́мошко. В современной России фамилия редкая, её носители — потомки тех, кто в разное время переселился из Малороссии в центральные губернии или на Дон.