Фамилия Самойлинских — один из тех редких случаев, когда написание в современном паспорте сохранило архаичную форму родительного падежа множественного числа. В русской ономастике фамилии на -их/-ых (Черных, Долгих, Косых) обычно застыли в форме родительного падежа, указывая на принадлежность к целому роду: «из семьи Самойлиных» или «из дома Самойлиных». Однако здесь основа не Самойл-, а Самойлин- — с суффиксом -ин, что делает конструкцию двойной. Получается, что фамилия образована по схеме: личное имя Самойло (просторечная форма от Самуил) → притяжательное прилагательное Самойлин («чей?» — сын Самойлы) → окончание -ских как показатель множественной принадлежности (типично для северных и сибирских говоров). Такой гибрид — «Самойлинских» — встречается редко и говорит о том, что фамилия фиксировалась в документах уже после того, как в быту устоялась форма «Самойлинские» или «Самойлины».

Само имя Самойло — это русская народная версия библейского имени Самуил, которое означает «услышанный Богом» (др.-евр. Шемуэль). В дореволюционной России это имя было распространено в крестьянской и мещанской среде, особенно в центральных и южных губерниях. От него образовались фамилии Самойлов, Самойленко, Самойлик, а форма Самойлин — более редкая, характерная для северных областей, где притяжательные прилагательные на -ин были основным способом образования фамилий от мужских имён, оканчивающихся на -а/-о (Самойло → Самойлин).

То, что фамилия закрепилась в форме Самойлинских, а не Самойлиных или Самойловых, указывает на её происхождение в среде, где ойконимический тип фамилий на -ских/-цких был особенно популярен — это территории бывшего Великого княжества Литовского, а также польско-украинское пограничье. Однако сочетание с суффиксом -ин выдаёт скорее русскую, а не польскую основу. Вероятнее всего, фамилия возникла на стыке культурных влияний: в южнорусских или западнорусских землях (например, на Брянщине, Смоленщине или в Белгородской области), где местные говоры охотно присоединяли фамильный формант -ских к уже существующим патронимам.

Таким образом, носитель фамилии Самойлинских может с высокой вероятностью считать своим предком человека по имени Самойло — крестьянина, ремесленника или мелкого служилого человека, жившего в XVII–XVIII веках. Сама фамилия — живое свидетельство того, как разные словообразовательные модели (патроним на -ин и родовой маркер на -ских) слились в одну, зафиксировав в себе и индивидуальное имя родоначальника, и коллективную память о целой семье.