Самсыкин — одна из тех фамилий, в которых слышен отзвук редкого или исчезнувшего имени. Её основа — Самсыка, и это не просто уменьшительная форма, а конкретный вариант крестильного имени Самсон. В народной речи имя Самсон, восходящее к древнееврейскому «шимшон» (солнечный), часто трансформировалось: через стяжение и добавление типичного для южнорусских говоров суффикса -ык(-ик) получалось Самсыка, то есть «маленький Самсон» или Самсон в ласковом, бытовом обращении.

Фамилия образована по простой и распространённой модели: к основе Самсык- добавлен суффикс -ин, который в русской традиции указывает на принадлежность. Самсыкин буквально означает «чей?» — сын, потомок или человек из рода Самсыки. Такие фамилии на -ин типичны для северных и центральных областей России, где они конкурировали с фамилиями на -ов. Встречается Самсыкин и в Поволжье, и в Сибири, куда фамилию могли занести переселенцы.

Стоит отметить, что Самсыка — не единственная народная форма от Самсона. В тех же говорах бытовали Самсонка, Самсоня, а в украинской и белорусской среде — Самсонюк, Самсоненко. Но именно вариант с «ы» и суффиксом -ык встречается реже, что делает фамилию Самсыкин более локальной и узнаваемой. Если сравнивать с однокоренными, например, Самсонов — это прямая патронимическая фамилия от полной формы имени, а Самсыкин — от её простонародного, «домашнего» варианта.

Вероятно, предок носителя этой фамилии был человеком, которого в деревне или в семье звали не иначе как Самсыка. Никакого ремесла или прозвища по характеру за этим именем не стоит — только память о том, что имя Самсон в быту звучало мягче и короче. Фамилия не относится к числу дворянских или купеческих, её носители — в основном крестьяне и мещане, что подтверждается и данными переписей XIX века, где Самсыкины встречаются в основном в среде государственных крестьян.