Фамилия Самушкин образована от имени Самушка. Самушка — это уменьшительно-ласкательная форма крестильного мужского имени Самуил. Самуил – это древнееврейское имя. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Самушка, со временем получил фамилию Самушкин.