Фамилия Самушков — относительно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Разберём её по составу, чтобы понять, откуда она взялась. Основа — Самушк-, суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?»), то есть фамилия образована от прозвища или имени Самушко. Это, в свою очередь, уменьшительная форма от одного из крестильных имён, начинающихся на «Сам-»: Самуил (древнееврейское «услышанный Богом») или Сампсон (греческое «солнечный»). В русской народной традиции такие имена часто сокращали: Самуил превращался в Самушу, а Сампсон — в Самуню, Самуху или Самушку. Форма Самушко типична для украинского, белорусского и южнорусского говоров, где суффикс -к- в прозвищах был особенно распространён.

Модель образования проста: прозвище Самушко, как ласковое обращение к Самуилу или Сампсону, закрепилось за человеком, а его дети стали «Самушковыми» — то есть потомками Самушка. Фамилия могла возникнуть в среде крестьян или казаков, где такие патронимические фамилии на -ов были нормой. Географически фамилия Самушков встречается преимущественно в южных регионах России, а также в Беларуси и на востоке Украины — это косвенно подтверждает её южнорусские или малороссийские корни.

Интересная деталь: в некоторых говорах «самушкой» могли называть не только человека, но и домашнее животное, например, ласково — кота или собаку. Однако в основе фамилии всё же лежит личное имя, а не зоологическое прозвище: связь с церковными именами прослеживается чётче, чем с бытовой кличкой. Если и была альтернативная версия — от слова «сам» (в значении «хозяин», «главный»), то она слабая, так как суффикс -ушк- в русских прозвищах почти всегда образует уменьшительные формы от имён, а не от нарицательных слов.

Таким образом, Самушковы — это потомки человека по имени Самуил (реже Сампсон), которого в быту звали Самушко. Фамилия несёт отпечаток народной речевой культуры, где длинные библейские имена уживались с короткими домашними прозвищами.