Фамилия Саникова — женская форма фамилии Саников, и её происхождение напрямую связано с мужским именем или прозвищем Саник. Основа фамилии — Саник, а суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — «Саников», то есть сын или потомок Саника.

Само имя Саник — это краткая, уменьшительная форма от целого ряда крестильных имён, начинающихся на Сан-. В первую очередь, от имени Александр (через народные формы Саня, Саник). Но также возможно происхождение от Савва, Савелий, Самсон или даже Самуил. Такое стяжение имён — типичная черта русской народной ономастики: длинное церковное имя в быту сокращали до одного-двух слогов, а потом добавляли уменьшительный суффикс -ик (Саш-а → Саш-ик → Саник). Этот суффикс придавал имени ласкательный или фамильярный оттенок, примерно как «Сашенька», но в более простонародной форме.

Есть и вторая, менее распространённая версия. В некоторых говорах «саником» могли прозвать человека, который сани, то есть впрягал лошадь, или мастерил сани. Однако эта гипотеза слабее: прозвища от глаголов с суффиксом -ик встречаются редко, обычно они образуются через другие модели. Поэтому основная и самая правдоподобная версия — от имени Саник как производного от Александр.

Фамилия Саников (и Саникова) — не самая частая, но и не редкая. Она бытует преимущественно в центральных регионах России, особенно в бывших Владимирской и Нижегородской губерниях, где уменьшительные формы на -ик были особенно распространены. Среди однокоренных фамилий — Санин (от Саня), Саныгин (от Саныга), Саничкин. Фамилия Саникова стоит в том же ряду, но с более редкой уменьшительной основой, что делает её интересным свидетельством живой народной речи, где длинное имя Александр превращалось в короткое и уютное Саник.