Фамилия Саприна образована от уменьшительной формы Сапря старинного крестильного имени Сафрон (в народном произношении — Сапрон). Имя пришло из греческого языка и переводится как «здравомыслящий, благоразумный». Фамилия хранит след давней языковой привычки: в общеславянской речи звука «ф» не существовало, поэтому его заменяли на «п» или «х». Так Сафрон становился Сапроном, а его домашняя, обиходная форма — Сапря — и легла в основу фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Саприна буквально значит «дочь или жена Сапри» (в мужском варианте — Саприн). Такая модель типична для фамилий, которые закрепились в простонародной среде: их часто давали по имени отца, не добавляя дворянских окончаний вроде -ский. Поэтому можно предположить, что основатель рода Саприных — человек из простого сословия, крестьянин или посадский, чьё имя в документах записали через обиходное Сапря.

Интересно, что та же основа дала жизнь целому гнезду родственных фамилий: Сапронов, Сафронов, Сапрыкин, Сапрыгин. Все они восходят к одному имени, но разошлись по диалектам и разным манерам произношения. Саприна в этом ряду — одна из самых коротких и, возможно, самых редких форм, закрепившаяся в основном на юге России и в украинских землях, где «ф» традиционно заменяли на «п» особенно последовательно.

В написании фамилии нет ничего необычного: она подчиняется общим правилам русской орфографии и не меняет ударение, которое падает на второй слог — Саприна. Поскольку имя Сафрон было широко распространено среди православных, фамилия не привязана к конкретной местности или сословию, но её простонародный облик говорит о том, что предки носителей фамилии вряд ли принадлежали к знати.