Фамилия Сайдюкова — женская форма фамилии Сайдюков, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени дальнего предка по мужской линии. Словообразовательная модель проста: основа «Сайдюк» плюс типичный русский суффикс принадлежности -ов, указывающий на «сына Сайдюка» или «человека из семьи Сайдюка».

Сама основа «Сайдюк» — это, скорее всего, адаптация тюркского имени или прозвища. В тюркских языках распространено имя Саид (араб. «счастливый», «господин»), а суффикс -юк (или -ук) часто образует уменьшительные или ласкательные формы. Таким образом, Сайдюк могло означать «маленький Саид» или «Саид, сын такого-то». Эта версия выглядит правдоподобной, учитывая, что фамилии с корнем «Саид» (Саидов, Саидханов) встречаются у многих народов Поволжья и Кавказа, а суффикс -юк характерен для тюркских языков (сравните: Айдюк, Байдюк).

Менее вероятно, но не исключено, что в основе лежит славянское прозвище от глагола «садить» или существительного «сад». Однако в таком случае форма была бы скорее Садюков (с одной «д» и без «й»). Наличие в корне «Сайд-» с гласной «й» и последующей «ю» — сильный аргумент в пользу иноязычного заимствования.

Фамилия Сайдюков (и Сайдюкова) — относительно редкая. Она встречается в южных регионах России, в частности в Ростовской области и на Северном Кавказе, что косвенно подтверждает её тюркские корни. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) она не упоминается, что говорит о её локальном бытовании и, возможно, позднем оформлении — в XIX–XX веках, когда фамилии фиксировались у всех сословий, включая крестьян и казаков.

Итак, предок, носивший прозвище Сайдюк, скорее всего, был человеком, чьё имя или отчество звучало как Саид, а окружающие называли его ласково — Саидюк. Со временем это прозвище закрепилось за его потомками как фамилия.