Фамилия Сеилханова — редкий пример, где женская форма сразу указывает на географию и этническое происхождение. В русской традиции фамилии на -ова образуются от мужских на -ов, но здесь основа не славянская, а казахская или тюркская. Мужской вариант — Сеилханов.

Корень фамилии — составное личное имя Сеилхан. Первая часть, Сеил, восходит к арабскому «сайид» (господин, потомок пророка) или к тюркскому «сейіл» (прогулка, шествие, но в именах чаще — почтительная форма). Вторая часть, хан, в тюркских языках означает «владыка, правитель». Таким образом, имя Сеилхан буквально переводится как «господин-хан» или «почтенный хан» — типичный для кочевой аристократии композит, подчеркивающий знатность и уважение.

Модель образования проста: к имени Сеилхан добавили русский патронимический суффикс -ов (чей? — сын Сеилхана), а затем к мужской фамилии — стандартное окончание -а для обозначения женщины. В казахской среде такие фамилии на -ов/-ова закрепились в советский период, когда проводилась массовая русификация документов. До этого у казахов не было наследственных фамилий в европейском понимании — использовали имя отца (Сеилханулы — «сын Сеилхана»).

Поскольку фамилия редкая, её носители, скорее всего, сосредоточены в Казахстане и среди казахской диаспоры. В ономастических справочниках по русским фамилиям (например, у Б. Унбегауна) её не найти — это не русская, а национальная фамилия, адаптированная к русской грамматике. Сословная принадлежность предков не восстанавливается без генеалогии: имя Сеилхан могли носить как потомки степной знати, так и простые кочевники, получившие его в честь уважаемого родственника. Единственное, что можно сказать с уверенностью: основатель рода был человеком, чьё имя содержало пожелание власти и достоинства.