Фамилия Сейлханова происходит из казахской и тюркской ономастики, что сразу заметно по её строению. Основа — «Сейлхан» — это составное мужское имя, распространённое у казахов, татар, башкир и других тюркских народов. Первая часть «Сейл» восходит к арабскому «сайид» (господин, потомок пророка) или к тюркскому «сейіл» (поток, разлив), что в переносном смысле могло означать «обильный» или «щедрый». Вторая часть — «хан» — титул верховного правителя, восточный владыка. В антропонимике такое сращение давало значение «благородный правитель» или «хан из рода сайидов». Фамилия Сейлханова — это женская форма, образованная добавлением русского суффикса -ова, который в XIX-XX веках закрепился в документах у казахов и других народов Российской империи при записи фамилий. Мужской вариант — Сейлханов.

Словообразовательная модель здесь типична для тюркских фамилий, адаптированных через русскую грамматику: личное имя (Сейлхан) плюс патронимический суффикс -ов/-ева. Суффикс указывает на принадлежность: «из рода Сейлхана». В самой казахской среде такие фамилии стали массово фиксироваться в советское время, когда проводилась паспортизация, поэтому предки носительницы фамилии были, скорее всего, кочевниками или оседлыми скотоводами, которые получили официальную фамилию по имени деда или отца. Среди казахов имя Сейлхан встречается нередко, но фамилия в целом не принадлежит к числу самых распространённых — она региональна и чаще бытует в южных и западных областях Казахстана, а также среди казахской диаспоры в России (например, в Астраханской и Оренбургской областях).

Стоит отметить, что в отличие от многих русских фамилий, которые заканчиваются на -ин или -ов от прозвищ, здесь основа — готовое имя, а не прозвище. Это делает фамилию прозрачной для носителя тюркского языка: любой казах сразу поймёт, что Сейлханова — это «дочь или жена Сейлхана». В русском контексте фамилия звучит непривычно, но её происхождение — прямое свидетельство межкультурного взаимодействия: тюркское имя получило русское окончание, и сегодня она существует как полноценная фамилия в российских и казахстанских документах. Споров о корне здесь немного — обе части общепонятны, хотя точное значение «Сейл» может варьироваться от региона к региону.