Фамилия Секретенко — характерный пример восточнославянской модели фамилий на -енко, самой распространённой на украинских землях. Суффикс -енко в XVI–XVIII веках в Поднепровье и Слобожанщине означал не только прямое родство («сын» или «маленький»), но и принадлежность к роду человека, названного в основе. Так, Секретенко — буквально «сын Секрета».

Основа Секрет — не тайна и не шифр, а прозвище, восходящее к слову «секретарь» в его старом, народном произношении. В южнорусских и малороссийских говорах слово «секретарь» нередко усекали до «секрет», а самого писаря или грамотного служащего называли Секретом. Такое прозвище мог получить грамотный казак, войсковой писарь, приказной дьяк в полковой канцелярии или просто человек, умевший читать и писать — в среде, где грамотность была редкостью, это сразу выделяло человека и давало ему прозвание по должности.

Менее вероятная, но встречающаяся в ономастике версия — происхождение от мирского (нецерковного) имени Секрет. В древнерусской традиции существовали охранительные имена, данные «от сглаза»: назвать ребёнка Секретом (то есть «тайным», «скрытым») — чтобы злые силы не нашли. Однако для фамилии Секретенко эта гипотеза слабее: прозвищный разряд «по занятию» для форм на -енко типичнее, чем редкие дохристианские имена.

Любопытно, что в Российской империи после введения рекрутской повинности и подушных переписей фамилия Секретенко фиксируется в основном в Полтавской, Харьковской и Екатеринославской губерниях — то есть в регионах, где казацкая старшина и войсковые канцелярии создавали спрос на грамотных людей. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка происходил из среды казачества или мещанства, имевших отношение к письменному делу — от полкового писаря до сельского дьячка.

В отличие от фамилий Секретарёв или Секретарский, которые прямо указывают на должность, Секретенко сохраняет уменьшительно-родовой оттенок: это не сам секретарь, а его потомок или человек, приписанный к его роду. Такая модель типична для украинской антропонимии, где суффикс -енко выполнял роль фамильного патронимика.