Фамилия Семениихен — один из тех редких случаев, когда русская по корню фамилия сохранила иноязычный суффикс. Основа здесь очевидна: мужское имя Семён (каноническая форма Симеон, от древнееврейского «шема» — «слышащий»). Но вот окончание «-ихен» — это немецкий уменьшительный суффикс, характерный для диалектов восточной Германии и Прибалтики. В русском языке такой модели образования фамилий нет, и это сразу указывает на сложную этническую историю семьи.

Скорее всего, фамилия возникла в среде немецких колонистов, которые с XVIII века селились в Поволжье, на юге Украины или в Прибалтике. Русское имя Семён дали ребёнку, а немецкое окружение переделало его на свой лад: Семён + -ихен (уменьшительно-ласкательное, как «Хансикен» от Ганс). Позже, при русификации, фамилия закрепилась в такой гибридной форме. Другая, менее вероятная версия — что это русифицированная передача немецкой фамилии Semenichen, где суффикс -ichen тоже уменьшительный, но тогда основа могла быть не от Семёна, а от немецкого прозвища.

Географически фамилия почти не встречается в центральной России. Основные следы — в документах по Запорожской области и Крыму, где исторически были немецкие колонии. Также единичные носители есть в Прибалтике. По сословной принадлежности предки были, скорее всего, крестьянами-колонистами или ремесленниками, а не дворянами — немецкие фамилии на -ихен в Российской империи не характерны для высших сословий.

С точки зрения словообразования это редкий случай контаминации: русское имя + немецкий суффикс. В ономастике такие фамилии называют «гибридными» и ценят как маркер межкультурных контактов. Если сравнивать с однокоренными — Семёнов, Семин, Семенюк — Семениихен стоит особняком: он не вписывается ни в патронимическую модель на -ов, ни в украинскую на -ук, а демонстрирует прямую адаптацию имени через чужую грамматику.