Фамилия Семенихен — редкий случай, когда географию происхождения можно определить почти безошибочно. Суффикс -ихен выдает в ней северо-западный след, а точнее — псковский или новгородский говор. В этих краях фамилии на -их, -ых, -его, -ово встречаются куда чаще, чем в остальной России, но форма на -ихен — совсем локальное явление. Она возникла в результате стяжения: полная форма звучала как Семенихин, но в быстрой речи окончание редуцировалось, и на письме закрепился вариант без последнего согласного. Такое же превращение мы видим в фамилиях Петрихен, Иванихен, Ванихен, которые до сих пор встречаются в Псковской области и на юге Ленинградской.

Основа фамилии — имя Семён, его разговорная форма Семеня или Семеняга. Суффикс -их- в русских фамилиях указывает на принадлежность: Семениха — жена или вдова Семёна. Соответственно, Семенихен — это «чей?» — сын Семенихи, то есть потомок женщины, которую в деревне называли по мужу. Такая модель типична для северных и сибирских говоров, где фамилии на -их закрепились раньше, чем в центральных областях. Однако именно окончание -ен вместо -ин — это уже не диалектная черта, а результат местного произношения, записанного в документах.

Споров вокруг корня нет: Семён — каноническое имя, восходящее к древнееврейскому Шимон («услышанный Богом»). В русской среде оно было одним из самых распространенных, поэтому фамилий от него десятки: Семёнов, Семин, Семенихин, Семеняка, Семенчук. Семенихен стоит в этом ряду особняком именно из-за редкой суффиксальной формы. Если ваши предки носили эту фамилию, с высокой вероятностью они жили в псковских или новгородских деревнях, где в XVII—XVIII веках крестьян записывали «по уличному прозвищу» — не по отцу, а по матери, точнее по тому, как звали хозяйку двора.

В современных справочниках и телефонных базах фамилия Семенихен встречается единично, в основном в Пскове, Великих Луках и окрестностях. За пределами этого региона она почти не фиксируется. Это не фамилия дворянского или купеческого сословия — её носители, скорее всего, были государственными или помещичьими крестьянами, а после отмены крепостного права — мещанами или крестьянами-отходниками. Никаких известных исторических личностей с такой фамилией не обнаружено, что для столь локальной формы вполне ожидаемо.