Фамилия Семенюков напрямую связана с именем Семён, но путь, который она прошла, длиннее, чем кажется на первый взгляд. В основе лежит имя Семенюк — народная, обиходная форма крестильного имени Симеон. В переводе с древнееврейского оно означает «услышанный Богом в молитве», что делало его одним из самых распространённых на Руси. Отсюда и огромное количество производных фамилий: от Семенова до Семенихина. Семенюков стоит в этом ряду особняком благодаря суффиксу -юк, который в русском языке встречается реже, чем привычные -ов или -ин.

Суффикс -юк характерен для украинской и белорусской традиции, где он обозначал «сына» или «потомка»: Семенюк — буквально «маленький Семён» или «сын Семёна». Таким образом, фамилия Семенюков — это уже русифицированная версия: к украинской основе добавили русский патронимический суффикс -ов, чтобы получить прилагательное, отвечающее на вопрос «чей?». Получается двойное указание на родство: и через уменьшительную форму имени, и через отчество. Такая модель встречается нечасто и говорит о том, что предки носителя фамилии жили на стыке культур — вероятно, на южнорусских землях, в регионах, граничащих с Украиной, откуда фамилия позже распространилась дальше.

Существует и альтернативная, более редкая версия происхождения — от прозвища Семенюк, которое связывают с глаголом «семенить», то есть идти частыми, мелкими шагами. Однако эта гипотеза выглядит заметно слабее. Прозвища от глаголов обычно образовывались иначе — через отглагольные существительные вроде Семеня или Семенуха, а форма с суффиксом -юк прочно ассоциируется именно с именами. К тому же имя Симеон было настолько популярно, что вероятность прозвищного происхождения здесь минимальна. Скорее всего, версия с «семенящей походкой» возникла как народное переосмысление уже готовой фамилии, когда её первоначальный смысл забылся.

Если опираться на основную версию, то основатель рода Семенюковых был человеком, носившим имя Семён, а его дети и внуки стали называться Семенюками, а уже их потомки закрепили за собой окончательную форму Семенюковы. В этом смысле фамилия не несёт в себе характеристики характера или профессии — она чисто семейная, указывающая на родство. Но, как и в случае с любой фамилией от имени, за ней стоит конкретный человек, живший несколько веков назад, чьё имя оказалось настолько значимым для потомков, что они решили сохранить его в своём родовом прозвании.