Фамилия Сейфуллин — это прямое указание на арабское имя Сейфулла, что в переводе означает «меч Аллаха». Образована она по классической русской модели с суффиксом -ин, который в данном случае присоединился к основе, оканчивающейся на гласный -а. Имя Сейфулла — составное, популярное в мусульманских культурах, особенно у татар, башкир и народов Средней Азии. Поэтому, если искать корни, стоит смотреть прежде всего в сторону тюркских народов, исповедующих ислам, — Волго-Уральского региона или Казахстана.

Интересно, что в отличие от многих фамилий на -ин, которые в русском языке произошли от кратких прилагательных или прозвищ (типа «Бородин»), здесь мы имеем дело с прямой транслитерацией восточного имени. Сейфуллин — это не прозвище, а патроним, перешедший в фамилию: «сын Сейфуллы». Такой способ словообразования типичен для фамилий, которые возникли в среде крещёных татар или при переходе в русское подданство, когда мусульманские имена адаптировали под русские фамильные суффиксы.

В среде казахских и татарских родов встречается и вариант Сейфуллин, и более архаичный Сайфуллин. Разница в написании — это следствие разного произношения арабской буквы «са», которая в тюркских языках могла звучать и как «с», и как «сей». Фамилия нередкая, и её носители в XIX — начале XX века могли быть как муллами и религиозными деятелями (учитывая значение имени), так и обычными земледельцами или торговцами. Сословная принадлежность тут не закреплена — фамилия встречается и у дворян, и у крестьян, что говорит о её массовом характере.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Сейфуллин стоит в одном ряду с Абдуллиным (от «раб Аллаха») или Уразбаевым, где основа — тоже арабское или тюркское имя. Но в отличие, скажем, от фамилии Хайруллин («благо Аллаха»), Сейфуллин имеет ярко выраженную воинственную коннотацию — «меч». Это могло быть не просто имя, а прозвище, данное воину или защитнику, хотя впоследствии оно закрепилось как родовое.