Фамилия Сейтеров — редкая и неочевидная для русского уха. Если отбросить суффикс -ов, который просто указывает на принадлежность («чей?»), остаётся корень «сейтер». В русском языке такого слова нет, поэтому искать объяснение стоит в диалектах, тюркских заимствованиях или искажённых формах других имён.

Самая рабочая версия связывает Сейтерова с тюркским именем Сейтер. В основе лежит арабское «саййид» — господин, потомок пророка, а тюркский суффикс -тер мог дать значение «тот, кто из рода саййидов». В таком случае Сейтеров — это русифицированная форма фамилии, которую в Поволжье или Приуралье могли носить татары, башкиры или казахи, перешедшие в православие. Фамилия могла возникнуть, когда крещёного татарина записали по отцу: «Сейтеров сын».

Есть и более прозаичный вариант: Сейтеров — это искажённое Сеитов или Саитов. Звук «й» в диалектах легко переходил в «т» (сравните: «кайма» — «кайта»), а фамилия Сеитов (от имени Сеит) встречается гораздо чаще. По этой логике Сейтеров — всего лишь фонетический вариант, закрепившийся в какой-то одной местности из-за особенностей говора.

Третья, совсем редкая возможность — прозвище от слова «сейтер» в значении «ситец» (через немецкое Seide — шёлк). В южнорусских говорах так могли называть торговца тканями, но это лишь предположение без серьёзных подтверждений.

Географически Сейтеровы тяготеют к Оренбуржью, Башкортостану и Татарстану — регионам, где веками жили рядом русские и тюркские народы. В дореволюционных метрических книгах эта фамилия встречается среди крестьян и мещан, но никогда не была дворянской или массовой.