Фамилия Шафрова чаще всего женская, образованная от мужской фамилии Шафров. Если же говорить об исходной форме, то она принадлежит к распространенному типу русских фамилий на -ов/-ев, но с редкой иноязычной основой. В отличие от множества фамилий, образованных от крестильных имен или прозвищ, Шафров почти наверняка связан с тюркскими или арабскими корнями.

Скорее всего, в основе лежит слово «шафр» — вариант произношения арабского «сабр» (терпение, выдержка). В тюркских языках, особенно у татар и башкир, это имя или прозвище могло означать «терпеливый», «стойкий». Есть и другая версия: от персидского «шафар» (победа, успех) или от названия пряности шафран, но она менее правдоподобна, так как прозвища по названиям приправ в русской среде встречаются редко, а у тюркских народов фамилии от таких слов не фиксируются как массовые.

Фамилия Шафров могла возникнуть у крещеных татар или в среде русских, живших в тесном контакте с тюркским населением (например, в Поволжье или на юге России). Суффикс -ов указывает на патронимическую модель: «чей?» — «сын Шафра». Сам Шафр, как личное имя или прозвище, могло быть дано человеку за его спокойный нрав или как пожелательное имя (чтобы ребенок рос терпеливым). Встречается фамилия и в написании Шафров, без чередования, что для русского уха привычнее.

В дореволюционных источниках фамилия Шафров встречается среди купцов и мещан, но не в высших дворянских родах. Больше всего записей о Шафровых — в документах Казанской, Симбирской и Оренбургской губерний, что подтверждает восточное происхождение. Сегодня носители фамилии живут по всей России, но заметная доля сосредоточена в Татарстане и Башкортостане.