Фамилия Шалер — редкий пример, где носитель русского языка интуитивно чувствует «нерусское» происхождение. Основа здесь не славянская, и суффикс -ер, нетипичный для русских фамилий, указывает на германские или еврейские (ашкеназские) корни. В русском языке продуктивны суффиксы -ов, -ин, -ский, а -ер — это маркер немецкого или идиша, где он часто обозначает профессию (например, Müller — мельник, Schneider — портной).

Наиболее вероятная версия — происхождение от немецкого Schaller. В южнонемецких диалектах Schaller — это либо вариант фамилии Schallerer (тот, кто изготавливает или носит Schall — шум, звон), либо прозвище крикливого, громкоголосого человека. Вторая, более конкретная гипотеза — связь с профессией: в средневековой Германии Schaller могли называть глашатая или трубача, человека, подающего звуковые сигналы. В пользу этой версии говорит и то, что в баварском диалекте schallen означает «звучать, греметь».

Третья, менее очевидная, но возможная линия — еврейская. Фамилия Шалер (Schaler) могла возникнуть как вариант написания фамилии Шаллер (Schaller) у ашкеназов, либо как топонимическая — от названия местечка Шале (Schale) в Восточной Пруссии. В любом случае, в Российской империи такие фамилии фиксировались преимущественно у немцев-колонистов (в Поволжье, на Волыни) и у евреев в черте оседлости.

В русском языке фамилия Шалер не склоняется по падежам, если принадлежит мужчине, и не склоняется, если женщине — это типично для заимствованных фамилий на согласный. Географически в современных российских базах данных она встречается точечно, без выраженного ареала, что подтверждает её пришлый характер: предки носителей, скорее всего, переселились в Россию в XVIII–XIX веках. С точки зрения словообразования, это «чистая» основа без славянского патронимического суффикса, что сразу выделяет её из ряда соседских Ивановых и Петровых.