Фамилия Шелопутова — женская форма, а её основа мужская — Шелопутов. Вглядитесь в корень: «шел-» здесь не от французского шарма, а от глагола «шел(ь)» — так в старых русских говорах называли повесу, шатуна, человека, который «шляется» без дела. Вторая часть — «-пут» — от «путь». Прозвище Шелопут, а значит и фамилия, описывало человека, который ходит не по дороге, а как придётся: бродягу, беспутного гуляку, того, кто «шёл не туда». Слово «шелопу́т» фиксируется в словарях русских народных говоров именно с таким значением — нерадивый, легкомысленный человек.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: основа прозвища плюс патронимический суффикс «-ов». То есть Шелопутов — буквально «сын Шелопута». Суффикс указывает на то, что фамилия сформировалась в центральных и северных регионах России, где преобладала модель на «-ов/-ев», а не на «-ин» или «-ский». В южных и западных землях чаще встречались бы формы вроде Шелопутенко или Шелопутич.

Интересно, что прозвище Шелопут не было уникальным. В документах XVI–XVII веков встречаются люди с таким именованием, например, в писцовых книгах Новгородской земли. Прозвище давали не обязательно в укор — иногда с иронией, а иногда и как «оберег»: считалось, что если назвать ребёнка неблагозвучно, злые силы к нему не пристанут. Так что предки Шелопутовых могли быть и крестьянами, и посадскими людьми, но точно не боярами — прозвище слишком простонародное.

В современной России фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях и на Урале. Вариант написания с двумя «л» (Шеллопутов) — ошибка, связанная с ложной этимологией («шёл» + «путь»). На самом деле в корне одна «л»: шелопут — слово, родственное «шалыган» (озорник) и «шалопай».