Фамилия Шенчукова — женская форма фамилии Шенчуков, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени. Основа «Шенчук» — это типичная для восточнославянских земель модель с уменьшительно-ласкательным суффиксом -ук/-юк, который особенно распространён на Украине и в Белоруссии. Суффикс указывал на молодость, сыновство или принадлежность: Шенчук — это «маленький Шен» или «сын Шена». Таким образом, ядро фамилии — короткое имя или прозвище Шен.

Корень «Шен» — редкий и спорный. Самая вероятная версия: это фонетический вариант имени Семён (в народном произношении — Сень, Сеня, через чередование с/ш). В южнорусских и украинских говорах «Сень» легко переходило в «Шень»: звук [с’] перед мягкой гласной мог озвончаться или заменяться на шипящий. Тогда Шенчук — это «Семёнов сын» или «внук Семёна». Менее вероятно, но возможно, что прозвище Шен давали человеку с какой-то особенностью: например, от диалектного «шеня» (щенок) или от тюркского слова «шен» (радость, веселье) — в южных степных регионах контакты с тюрками были обычны.

Модель образования Шенчукова — типичная «матронимическая» или «патронимическая» с суффиксом -ов, но с прибавлением женского окончания -а. В русской традиции фамилии на -уков/-юков чаще всего принадлежали крестьянским и мещанским родам из западных губерний (Черниговская, Полтавская, Киевская), а также из южнорусских областей (Курская, Воронежская). Шенчуковы могли быть потомками казаков или однодворцев — людей, которые несли сторожевую службу на границах и получали землю за верную службу. Фамилия не дворянская, не княжеская, а народная, бытовая.

В написании фамилии возможны варианты: Шинчукова (через и) или Шенчук (без окончания -ов) — в украинском варианте фамилия часто остаётся без суффикса принадлежности. Но форма Шенчукова закрепилась именно в русской среде, где к основе на -ук добавили типичный русский суффикс -ов, чтобы фамилия склонялась по образцу прилагательных. Это говорит о том, что род, скорее всего, обрусел или перешёл на русскую антропонимическую норму в XIX–XX веках.

Если искать однокоренные фамилии, то это Шенчук, Шенюк, Шенёв, Сенчуков. Сравнение с ними показывает, что Шенчукова — одна из форм, возникшая в зоне смешения украинской и русской традиций. Географически фамилия сегодня встречается в России (особенно в Воронежской, Ростовской областях и в Краснодарском крае) и на востоке Украины. Точных данных о древности рода нет, но по модели образования фамилия могла сложиться не позднее XVII–XVIII веков, когда активно оформлялись постоянные фамилии у непривилегированных сословий.