Фамилия Шепетинский — из тех, что сразу указывают на географию. Её основа — топоним Шепетин (или Шепетино), а суффикс -ский в русской традиции чаще всего выдаёт дворянское или шляхетское происхождение: так образовывали фамилии владельцы поместий или выходцы из конкретного села. В данном случае речь почти наверняка идёт о местечке Шепетин — такое название носит село в Ровненской области Украины (историческая Волынь). Оттуда и пошла фамилия: «Шепетинский» — «тот, кто родом из Шепетина».

Корень «шепет» в западнорусских и украинских говорах имеет два значения. Первое — «шёпот», второе, более вероятное для названия поселения — «шепет» как «щебень, мелкий камень, хрящ». Если село стояло на каменистой почве или возле реки с каменистым дном, название могло закрепиться именно по этому признаку. В этом случае фамилия Шепетинский восходит не к личному прозвищу, а к ландшафту.

Словообразовательная модель проста: основа Шепетин- (от названия населённого пункта) плюс типичный для польско-украинского пограничья суффикс -ский. В Речи Посполитой такие фамилии массово получала местная шляхта, писавшаяся «с имения». После разделов Польши и вхождения Волыни в состав Российской империи часть носителей фамилии могла перейти в мещанское или духовное сословие — точных данных по Шепетинским нет, но общая логика подсказывает, что изначально это была фамилия землевладельцев средней руки.

У фамилии есть редкая особенность: она почти не встречается за пределами исторической Волыни и соседних регионов Беларуси. В современных российских базах Шепетинских немного, и большинство из них — потомки переселенцев конца XIX — начала XX века. В украинских же переписях фамилия держится преимущественно в Ровненской и Житомирской областях, что подтверждает её локальный характер.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Шепетинский стоит отличать от Шепетовского (от города Шепетовка) и Шепетюка (украинская форма на -юк, означающая «сын или работник Шепета»). Суффикс -инский в данном случае жёстко привязан к конкретному селу, а не к личному имени или прозвищу, что делает фамилию «географически точной» — в отличие от более размытых Шепетовых, которые могли возникнуть в любом регионе от прозвища «шептун».