Скорее всего, она образована от прозвища Шинкарь, которое восходит к украинскому слову «шинкар» - владелец шинка или продавец в нем. Согласно менее вероятной версии, прозвище могло быть связано со словом «шинка» - копченое мясо, свиной окорок, приправленный пряностями. Возможно, Шинкарём нарекали любителя такого блюда или человека, который коптил мясо. Так и прозвище Шинкарь закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Шинкоренко. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шинкарь, со временем получил фамилию Шинкоренко.