Фамилия Шкирский — один из тех случаев, где за внешне простой основой скрывается сразу несколько возможных путей происхождения, и каждый из них по-своему интересен. Если отбросить самые надуманные гипотезы, остаются две основные версии, и обе ведут в западные или юго-западные земли бывшей Российской империи.

Фамилия образована по типичной для польской, украинской и белорусской ономастики модели с суффиксом -ский. Этот суффикс указывал либо на дворянское происхождение (шляхетский гербовник), либо на связь с географическим названием — селом, местечком, урочищем. В случае Шкирского «географическая» версия выглядит предпочтительнее: на картах Беларуси и Украины встречаются топонимы вроде Шкир, Шкировка, Шкирки. В таком случае фамилия означает «тот, кто родом из Шкира» — типичная модель для фамилий шляхты и крестьянства, переселявшихся в центральные губернии России.

Вторая версия — прозвищная, и она не менее правдоподобна. В южнорусских и украинских говорах слово «шкира» (или «шкура») могло произноситься с характерным «иканьем». Прозвище Шкира давали человеку либо с грубой, «толстокожей» внешностью, либо, наоборот, кожевнику или скорняку — ремесленнику, работавшему со шкурами. Суффикс -ский в этом случае — не указание на знатность, а позднейшая русификация фамилии при переходе в официальные документы: «Шкирин» или «Шкиров» звучало бы проще, но «Шкирский» придавало фамилии более «благородный» оттенок.

В словарях фамилия нечастотна, что говорит о её узколокальном происхождении. Скорее всего, Шкирские — потомки либо мелкой шляхты из-под Могилёва или Гродно, либо выходцев из казачьих земель (Черниговщина, Полтавщина), где прозвища на -ский давали не только по деревне, но и по характерному занятию. Разобраться точнее помогла бы география расселения: если ваши предки родом с запада — версия с топонимом сильнее, если с юга России — скорее, ремесленное прозвище.