Фамилия Сиднякова образована от мужского прозвища Сидняк. В его основе — глагол «сидеть» или прилагательное «сидний», то есть «сидячий, малоподвижный». Прозвище Сидняк могли дать человеку, который вёл оседлый образ жизни, редко покидал дом, либо тому, кто по болезни или роду занятий подолгу оставался на месте — например, ткачу или сапожнику, работавшему сидя. В северных и сибирских говорах «сиднем» называли также домоседа, а в некоторых регионах — человека, который «сидит на печи», то есть ленивого или больного. В любом случае прозвище звучало необидно, скорее описательно.

Фамилия закрепилась через патронимический суффикс -ов, типичный для русских фамилий центральных и северных губерний. Форма Сиднякова — женская, от мужской Сидняков. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Сидняко́ва, хотя в говорах возможно смещение.

Интересно, что фамилия Сидняков встречается в документах XVII века, например, в переписных книгах Вятки и Перми Великой, что указывает на её раннее бытование в среде черносошных крестьян и посадских людей. В отличие от более распространённых «сидячих» фамилий — Сидоров, Сидоровых — у Сиднякова редкий суффикс -няк, который обычно образовывал прозвища от действий (толкач — толкать, ходяк — ходить). Таким образом, Сидняк — это «тот, кто сидит», с оттенком постоянства или привычки. Фамилия недвусмысленно указывает на образ жизни предка, но без резкой отрицательной окраски.

Географически фамилия привязана к северо-востоку европейской России. В современных базах данных носители фамилии Сидняков встречаются в Кировской, Архангельской областях и Пермском крае, что подтверждает историческую локализацию.