Фамилия Сидонова — яркий пример того, как на русской почве женская форма фамилии сохраняет память о редком или заимствованном имени. В отличие от типичных «Сидоровых» или «Сидоркиных», основа здесь не от крестьянского имени Сидор (от греческого «дар Исиды»), а от библейского географического названия Сидон — древнего финикийского города. Мужская форма фамилии — Сидонов, и она указывает на то, что предок носительницы фамилии получил прозвище или фамилию по месту, откуда был родом, либо по торговым связям.

Словообразовательная модель проста: суффикс -ов- присоединился к основе «Сидон». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от названий городов или местностей: Москвин, Тверитин, Ростовцев. Однако Сидонов стоит особняком: Сидон — не русский город, а библейский, известный по Ветхому Завету как центр ремесел и торговли. Вероятнее всего, фамилия возникла в среде духовенства или купечества. Священники, получавшие фамилии при семинарском обучении, часто брали названия библейских местностей — отсюда и Сидонов. Купцы же, торговавшие с восточными странами, могли получить прозвище «Сидон» за то, что привозили товары из тех краев, или за внешнее сходство с жителями тех земель.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с греческим именем Сидоний (от того же Сидона), которое могло попасть в русские святцы. В этом случае фамилия Сидонов — отчество от крестильного имени, но это редкий случай, так как имя Сидоний в народном быту почти не встречалось.

Географически фамилия Сидонова не привязана к одной области, но чаще фиксируется в южных регионах России и в Поволжье — там, где были сильны старообрядческие и купеческие традиции. Встречается она и в среде казачества, где фамилии нередко давались по «заморским» прозвищам. В любом случае, носительница фамилии Сидонова может быть уверена: её предки либо имели отношение к церковной среде, либо занимались торговлей, либо обладали яркой внешностью, напоминавшей о далёком библейском городе.