Фамилия Симахана — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с исходной формой слова, от которого она, скорее всего, произошла. В русских фамилиях суффикс -а характерен для украинской или белорусской традиции, но здесь он не суффикс, а часть корня. Фамилия явно не славянская по происхождению, и её носители, вероятно, имеют восточные корни.

Самая прямая версия — фамилия происходит от арабского имени Симахан (или Симаханум), которое распространено у народов, исповедующих ислам, особенно у татар, башкир, народов Кавказа и Средней Азии. Имя состоит из двух частей: «Сим» (возможно, вариант «Сим» как имя библейского персонажа или искажённое «Син» — «грудь») и «хан» — титул правителя. В тюркских языках «хан» часто добавлялся к именам как знак уважения или пожелание власти. Таким образом, Симахана могла означать «подобная хану» или «хан Сима» (если первая часть — личное имя).

Второй вариант, менее вероятный, но возможный для регионов с сильным иранским влиянием, — связь с персидским «симах» (символ, знак) и «хан». В этом случае фамилия могла указывать на человека, который носил особый знак или печать хана. Однако эта версия не имеет устойчивой ономастической поддержки.

Географически фамилия Симахана встречается в основном у татар, реже у народов Дагестана и Чечни, а также у выходцев из Азербайджана. В русском контексте она могла закрепиться через метрические записи, где имя отца или прозвище записывалось в родительном падеже (чьих? — Симахана), что для восточных фамилий не редкость: «сын Симахана» со временем превратилось в фамилию без дополнительных суффиксов.

Сословная принадлежность предков была разной: от сельских жителей до представителей мусульманского духовенства или мелкой знати, если имя указывало на родство с ханским родом. Но однозначно утверждать, что все носители Симахана — потомки ханов, нельзя: имя могло даваться и как благопожелательное, без реального титула.