Фамилия Симонькины (в мужском варианте — Симонькин) происходит от уменьшительной формы крестильного имени Симон. Симонька — так в быту, в кругу семьи или в деревенской среде называли человека, носившего это библейское имя. Само имя Симон восходит к древнееврейскому и переводится как «внимающий», «услышанный Богом». В христианской традиции это имя связано с апостолом Симоном, которого также называли Кананитом и Зилотом, то есть «ревнителем» веры.

Словообразовательная модель здесь простая и очень распространённая: к основе Симоньк- добавили суффикс -ин, который указывает на принадлежность. Такой суффикс в русских фамилиях традиционно означал «сын такого-то» или «из семьи такого-то». Следовательно, Симонькин — это буквально «сын Симоньки». Подобным образом образованы десятки фамилий от народных форм канонических имён: Васькин, Петькин, Мишкин. Фамилия Симонькин стоит в этом ряду, но с тем отличием, что исходная форма Симонька встречается реже, чем те же Васька или Петька. Это делает фамилию заметной на фоне более частотных однокоренных образований.

Интересно, что от того же имени Симон возникло множество других фамилий: Симонов, Симонян, Симончук, Семаков. Но Симонькины стоят особняком — они сохранили именно ту форму, которая бытовала в разговорной речи, вероятно, в северных или центральных русских говорах, где уменьшительные имена с суффиксом -к- были особенно употребительны.

Точное время и место возникновения фамилии Симонькин сейчас установить сложно — массовое закрепление фамилий у крестьянства завершилось лишь к концу XIX века, а до этого носители имени Симонька могли десятилетиями жить без наследственного прозвания. Тем не менее, сама фамилия — живой памятник славянской письменности и культуры, сохранивший ту форму имени, которая давно вышла из активного употребления. Сегодня её носители могут с полным правом считать, что их предки носили имя, связанное с одним из двенадцати апостолов, и что в самом звучании фамилии застыла та простота и теплота, с которой на Руси относились к именам.