Фамилия Симонин — наглядный пример того, как одна буква в суффиксе меняет историю рода. В отличие от более частых Сидоровых или Ивановых, у Симониных исходное имя не Иван, а Симон. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Симонов, то есть сын или потомок Симона. Но в русских говорах имя Симон нередко произносили как Симоня — с мягким окончанием, отсюда и форма Симонин, а не Симонов.

Основа фамилии — каноническое имя Симон, которое пришло на Русь из греческого через церковнославянский язык. Восходит оно к древнееврейскому Шимон — «услышанный Богом». В православных святцах под этим именем известны апостол Пётр (носивший второе имя Симон) и Симон Кананит. Однако в быту имя давали не только в честь святых, но и просто как популярное в определённых слоях. Фамилия Симонин могла возникнуть и от производной формы Симоня — уменьшительно-ласкательного варианта, который в деревнях использовали для младших членов семьи.

Словообразовательная модель с суффиксом -ин характерна для северных и центральных областей России, особенно для новгородских и псковских земель. Там фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов, потому что основой служили не только полные имена, но и усечённые или обиходные формы. Если бы фамилия образовалась от полной формы, мы бы имели Симонов — и такие фамилии действительно существуют, но они отдельная ветвь.

Интересная деталь: в некоторых говорах имя Симон звучало как Семён, и наоборот — Семёна могли называть Симоном. Поэтому фамилия Симонин в ряде случаев могла быть диалектным вариантом от Семёна. Однако это менее вероятно, так как от Семёна сложились отдельные фамилии — Семёнов, Семин, Семочкин. Симонин же устойчиво привязан к форме Симон.

Социальный состав носителей фамилии был пёстрым. В переписных книгах XVII века встречаются крестьяне Симонины из-под Вологды, а в XVIII веке — мещане и купцы в городах Поволжья. Дворянских родов с этой фамилией не зафиксировано, что типично для фамилий на -ин от крестильных имён: они чаще принадлежали простым сословиям. Сегодня фамилия редкая, её можно встретить в Нижегородской, Костромской областях и в среде старообрядцев, где имя Симон сохраняли в старом произношении.