Фамилия Синигин образована от прозвища Синига. Синигой (синюгой) в старину называли человека, который красил ткани в синий цвет, либо выделывал синель – особый вид нитей. Однако в некоторых говорах глагол «синить» означал «красить ткани вообще, в любой цвет». По другой версии, в основе данной фамилии лежит мирское имя Синига, которое восходит к прилагательному «синий».Вполне вероятно, что в это имя был вложен особый смысл, связанный с символикой синего цвета. Синий цвет наиболее часто рассматривается как символ всего духовного. Это цвет мудрости. Он олицетворяет бесконечность, вечность, истину, преданность, веру, чистоту, целомудрие, духовную и интеллектуальную жизнь. В геральдической символике синий – цвет чести и целомудрия, цвет доброй славы и преданности. Кроме того, синий – цвет учености и стремления к глубинам познания, цвет алхимиков и философов. Наиболее раннее упоминание, содержащее однокоренную фамилию Синий, относится к XV веку. Веселовского записаны Синий Александр Семенович Жеребцов, начало XV в.; Иван Семенович Синий Рождественский Всеволож, вторая половина XV в. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Синига, со временем получил фамилию Синигин.