Фамилия Сипатров — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В ней сразу бросается в глаза окончание -ов, которое указывает на типичную русскую патронимическую модель: «чей?» — Сипатров, то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Сипатр. Однако такого имени нет ни в православных святцах, ни в распространённых славянских именниках. Значит, основа фамилии — прозвище или искажённое имя.

Самая вероятная версия ведёт к греческому имени Исидор (в русской народной форме Сидор) или к его производным. В диалектах и просторечии имя Сидор могло трансформироваться в «Сипатр» через замену звуков: Сидор → Сидорка → Сипатка → Сипатр. Подобные фонетические сдвиги (д в п) встречаются в говорах, особенно при быстром произношении. Суффикс -ов добавляет значение принадлежности: «Сипатров» — из рода Сипатра. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть человеком по имени Сидор, которого в округе звали уменьшительно-пренебрежительно Сипатр.

Менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с тюркскими корнями. В татарском и башкирском языках есть имя Сипатр, образованное от «сипат» — «черта, качество, свойство». Однако фамилия с русским суффиксом -ов у тюркских народов встречается редко и обычно указывает на обрусение. Если принять эту версию, то Сипатровы могли происходить из поволжских татар или башкир, принявших православие.

Географически фамилия встречается разрозненно, без явного гнезда. В дореволюционных переписях её фиксировали в основном в центральных губерниях России, что скорее подтверждает версию о русском происхождении от имени Сидор. Встречаются варианты написания — Сипатров и реже Сипатровъ. Сословной принадлежности предков по одной фамилии не определить: Сипатровыми могли быть и крестьяне, и мещане, и купцы — всё зависело от конкретной семьи.