Фамилия Скарлухин — редкая и любопытная именно своей основой. В отличие от множества фамилий на -ин, образованных от крестильных имён (Иван — Иванов, Ильин), здесь в корне лежит не имя, а прозвище или географическое название. Слово «скарлуха» в русских говорах имело несколько значений, и все они связаны с твёрдой оболочкой. В южных и западных диалектах так называли скорлупу яйца или ореха, а в переносном смысле — скупого, «закрытого» человека, которого не «раскусить». Встречалось и значение «старая, потрескавшаяся кожа» — так могли прозвать морщинистого или загрубевшего от работы человека.

Модель образования фамилии проста и архаична: суффикс -ин указывает на принадлежность. Скарлухин — буквально «сын Скарлухи», то есть человека, носившего прозвище Скарлуха. Фамилии на -ин в этой зоне часты, но основа «скарлух-» почти не встречается в официальных документах XVII–XVIII веков, что говорит о её локальном бытовании. Вероятнее всего, фамилия сформировалась в среде крестьян или ремесленников Центральной России или Поволжья, где слово «скарлуха» было в ходу.

Есть и вторая, менее вероятная версия: связь с украинским или белорусским «скарлупка» (скорлупа) и, соответственно, западнорусским ареалом. Но суффикс -ин, а не -енко или -ук, указывает на великорусскую, а не малороссийскую традицию. Если бы фамилия возникла на Украине, она звучала бы как Скарлупенко или Скарлупка.

В писцовых книгах и переписях XIX века фамилия Скарлухин встречается единично — например, в Тамбовской и Рязанской губерниях. Это подтверждает версию о прозвище: в этих краях «скарлухой» могли назвать прижимистого хозяина или человека с грубой, огрубевшей кожей. Никаких знатных родов с такой фамилией не зафиксировано — она осталась в низовых слоях населения, что типично для прозвищных фамилий, не связанных с церковным календарём.

Таким образом, Скарлухин — фамилия-характеристика, возникшая в крестьянской среде. Её носитель, скорее всего, потомок человека, которого в деревне прозвали за внешность или нрав Скарлухой. Сегодня фамилия остаётся редкой, и её обладатели могут с высокой вероятностью проследить корни до Центрального Черноземья или Поволжья.