Фамилия Скибинецкий — один из тех случаев, когда географическая привязка видна сразу, а вот исходное значение приходится восстанавливать по косвенным данным. Типичный суффикс -ский указывает на дворянское или шляхетское происхождение, но в XIX веке такие фамилии массово получали и выходцы из духовенства, и крестьяне, переселившиеся в другие места. В основе почти наверняка лежит топоним — название населённого пункта Скибинцы или Скибинец.

Такие названия встречаются в западнорусских землях: на Волыни, в Подолье, на Правобережной Украине. Корень «скиб-» в местных говорах означал ломоть, кусок, отрезанную часть. Скибой называли и отдельный клин пашни, и небольшой участок земли, отрезанный от основного надела. Соответственно, Скибинец — это либо «житель места Скибин», либо прозвище человека, владевшего таким отрезанным клочком земли. В польском языке есть слово skiba с тем же значением, так что фамилия могла возникнуть и в среде польской шляхты, осевшей на украинских землях.

Менее вероятна, но не исключена версия от прозвища Скиба — так могли назвать человека с грубой речью или скупого, «отрезающего» лишнее. Однако в пользу географического объяснения говорит именно суффикс -нецкий: он типичен для фамилий, образованных от названий на -инцы, -овцы. Сравните: Скибинцы → Скибинецкий, как Козинцы → Козинецкий.

Встречается фамилия и в форме Скибінецький — с украинским написанием. Носители её рассеяны по всей Украине, Беларуси и югу России, но наибольшая концентрация традиционно приходится на Хмельницкую и Винницкую области. Сословная принадлежность предков могла быть разной: от мелкой шляхты до крестьян, получивших фамилию по месту выхода при переписях. Единого родоначальника у Скибинецких нет — это типичная «географическая» фамилия, которая возникала в разных местах независимо.