Фамилия Скрылина — женская форма, а мужская, Скрылин, образована с помощью одного из самых распространённых русских патронимических суффиксов — -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Скрылин буквально означает «сын Скрыли» или «человек из рода Скрыли». Основа здесь — прозвище Скрыля, которое и стало ядром фамилии.

Корень «скрыл» чаще всего связывают с глаголом «скрыть» или «скрывать». В таком случае Скрылей могли прозвать человека скрытного, нелюдимого, молчаливого — того, кто «держит всё в себе». В русских говорах слово «скрыля» фиксировалось и в значении «скупой, жадный», что тоже укладывается в логику прозвища: скрытность и скупость в народном сознании часто шли рука об руку.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным «скрыль» (или «скрыла»), обозначавшим некий изогнутый предмет, например, кривой нож или скобу. В этом случае прозвище могло относиться к ремесленнику, работающему с таким инструментом, или к человеку с характерной внешностью (сутулый, кривобокий). Однако эта гипотеза слабее: такие значения встречаются редко и локально, в основном в южнорусских говорах.

Географически фамилия Скрылин (и Скрылина) не привязана к одной области — она встречается и в центральных регионах России, и в Поволжье, и на Урале. Это говорит о том, что прозвище было распространённым, но не массовым: носители фамилии, скорее всего, происходят из разных крестьянских родов, где независимо друг от друга дали одному из предков меткое прозвище за характер.

Интересная деталь: фамилия Скрылин — не единственная с таким корнем. Существуют однокоренные Скрылёв, Скрыльников, Скрыпников (последние могут быть связаны уже со «скрипом», а не со «скрытием»). Но Скрылин стоит особняком: суффикс -ин указывает на прямое отчество от прозвища, а не от профессии, что делает его более древним по модели образования. В дореволюционных переписях фамилия встречается редко, что подтверждает её происхождение из личного, а не «должностного» прозвища.