Фамилия Скрылькова — женская форма, а мужская, Скрыльков, образована по самой распространённой в русской ономастике модели: от прозвища или нецерковного имени с помощью суффикса -ов. Основа здесь — «скрыль», слово, которое в русских говорах имело несколько значений, и именно от них отталкиваемся при поиске корней фамилии.

Самое вероятное объяснение: «скрыль» или «скрыля» — диалектное название скворца. В некоторых областях, особенно на юге и юго-западе России, птицу скворца называли именно так, от звукоподражательного «скыр-скыр». Тогда прозвище Скрыль могли дать человеку за голос, похожий на скворца, за певческие способности или за внешнее сходство — например, за пёструю одежду или суетливый нрав. В этом случае фамилия входит в обширную группу «птичьих» фамилий (Соловьёв, Воробьёв, Скворцов), но с локальным диалектным оттенком.

Есть и вторая версия, более редкая. В северных и сибирских говорах «скрыль» означало «щель, трещина, расщелина». Прозвище Скрыль могло достаться человеку, жившему у оврага или в узком ущелье, либо тому, кого считали «щелистым» — худым или пронырливым. Однако эта версия менее распространена: фамилии от топографических прозвищ чаще образуются с суффиксом -ин или -ский (Задорожный, Прибрежный), а здесь мы видим -ов, что типично для прозвищ по личным качествам или внешности.

Суффикс -к- в основе (Скрыль-к-ов) указывает на уменьшительно-ласкательную или пренебрежительную форму исходного прозвища: Скрылько — «маленький скворец» или «скворчонок». Такая модель характерна для украинского и южнорусского влияния, где суффикс -к- активно использовался в прозвищах. Это позволяет предположить, что корни фамилии — в южнорусских или малороссийских землях, где диалектное «скрыль» было в ходу.

Географически фамилия Скрыльков встречается нечасто, но фиксируется в Курской, Белгородской и Воронежской областях — как раз на стыке великорусских и украинских говоров. В дореволюционных источниках Скрыльковы упоминаются среди крестьян и однодворцев, что подтверждает простонародное происхождение фамилии.

Таким образом, Скрылькова — это фамилия, которая скорее всего ведет начало от прозвища Скрыль (скворец) с уменьшительным суффиксом, и предки её носителей были людьми, получившими это прозвище за голос, повадки или внешность.