Фамилия Слепеньков образована от прозвища Слепень. В русских говорах слепнем называли не только овода, но и близорукого или плохо видящего человека — «слепень» как «слепыш», «слепой». Прямой связи с насекомым здесь могло и не быть: прозвище давали тому, кто щурился, плохо различал предметы вдалеке или носил очки, когда они ещё были редкостью.

Суффикс -к- в основе Слепеньк- указывает на уменьшительную или пренебрежительную форму: Слепень — Слепенько. В украинской и южнорусской традиции такие формы на -ко (Слепенько, Слепенко) были распространены как самостоятельные прозвища. Когда носитель такого прозвища оказывался в великорусской среде, фамилию «подгоняли» под стандартную модель притяжательных прилагательных: Слепенько → Слепеньков, то есть «сын Слепенька». Это типичный случай адаптации украинской или южнорусской фамилии на -ко под общепринятый -ов.

Встречается фамилия в основном в центральных и южных областях России, особенно в Воронежской, Курской и Белгородской. Там же фиксируются и родственные формы: Слепень, Слепенков, Слепнев. Важно не путать Слепенькова с гораздо более частой фамилией Слепнёв: та образована напрямую от «слепень» без уменьшительного суффикса, а Слепеньков — от двухступенчатой модели (прозвище + уменьшительная форма + фамильный суффикс).

По сословному составу Слепеньковы — почти наверняка крестьянская или однодворческая фамилия. Однодворцы (особенно в Курской губернии) часто носили фамилии с таким же «уменьшительным» суффиксом, что отличало их от более поздних крепостных фамилий. Дворянских родов Слепеньковых в «Бархатной книге» и «Общем гербовнике» нет.