Фамилия Смокотинов — одна из тех, что хранит в себе память о прозвище, а не о крестильном имени. В её основе лежит слово «смокот» или «смокоток», которое в южнорусских и украинских говорах означало «комар», «мошкара», а также — «назойливый, приставучий человек». Сравните с украинским «смокотіти» — «зудеть», «пищать», «надоедать». Прозвище Смокот, скорее всего, дали либо очень маленькому и юркому человеку (по аналогии с насекомым), либо, наоборот, тому, кто постоянно докучал разговорами или просьбами.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе «Смокот» добавился суффикс -ин, а затем патронимический суффикс -ов. Получается «Смокотинов» — буквально «сын Смокотина», где Смокотин — это уже отчество от того же прозвища. Такая двойная суффиксация (-ин + -ов) встречается реже, чем просто -ов или -ин, и часто указывает на более позднее оформление фамилии, когда первоначальное отчество на -ин успело закрепиться, а потом к нему добавили «фамильный» суффикс. Впрочем, возможен и другой путь: Смокотинов могло возникнуть от более редкой формы Смокотя, где -ин- — не суффикс, а часть корня (Смокот-ин-ов).

Географически фамилия тяготеет к Курской, Белгородской, Воронежской областям и к востоку Украины — именно там фиксируются говоры со словом «смокот». В дореволюционных переписях носители Смокотиновых чаще всего встречаются среди однодворцев и государственных крестьян, то есть потомков служилых людей «по прибору», которые несли сторожевую службу на южных рубежах. Это объясняет, почему фамилия не ушла далеко на север: её ареал совпадает с исторической зоной засечной черты.

Интересно, что фамилия не имеет никакого отношения к «смокве» (инжиру) или к смокингу — это ложные этимологические параллели, которые иногда встречаются в дилетантских разборах. Корень здесь чисто звукоподражательный, связанный с писком и жужжанием. В «Словаре русских народных говоров» слово «смокот» зафиксировано именно в значении «комариная мелочь», и это надёжно отсекает версию о тюркском или греческом происхождении.

Известных исторических деятелей с фамилией Смокотинов не сохранилось — это фамилия недворянского сословия, которая не попала в родословные книги. Зато она даёт живую зарисовку: предок нынешних носителей, скорее всего, был невысоким, подвижным человеком с резким голосом, которого в деревне дразнили Комариком. Прозвище прижилось и через триста лет превратилось в официальную фамилию.