Фамилия Смолькин образована от прозвища Смолька. Прозвище Смолька, по одной из версий, относится к так называемым «профессиональным» именованиям, содержащим указание на деятельность человека. Первое в истории датированное упоминание Смоленска в Устюжском летописном своде относится к 863 году: по свидетельству летописца, он был тогда «град велик и мног людьми». Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Смолька, со временем получил фамилию Смолькин.