Фамилия Сморгунова — женская форма фамилии Сморгунов, и её происхождение напрямую связано с мужским прозвищем Сморгун. В русской ономастике это довольно редкий случай, когда основа фамилии образована не от имени или профессии, а от глагола со специфическим диалектным значением.

Корень здесь — «сморг-», который восходит к глаголу «сморгать» или «сморгнуть». В северных и центральных говорах России (особенно в вятских, новгородских, псковских) «сморгать» означало «мигать, щуриться, моргать». Прозвище Сморгун могли дать человеку с привычкой часто моргать, щуриться или иметь нервный тик глаза. Суффикс «-ун» в русском языке традиционно образует названия лиц по характерному действию (ср. «бегун», «крикун», «говорун»), так что Сморгун — это «тот, кто сморгает», то есть моргун.

Вторая, менее распространённая версия связывает основу с диалектным глаголом «сморгать» в значении «сбрасывать, стряхивать» (например, сморгнуть росу с ресницы). В этом случае прозвище могло относиться к человеку суетливому или, наоборот, аккуратному, стряхивающему пылинки. Однако первая версия — с физиологической особенностью — выглядит убедительнее, так как прозвища по внешним признакам и повадкам были массовыми в крестьянской среде.

Географически фамилия Сморгуновы (и Сморгунова) встречается прежде всего в регионах Русского Севера и Вятки, где фиксировались соответствующие говоры. В документах XVII–XVIII веков можно найти упоминания крестьян и посадских людей с прозвищем Сморгун в Архангельской и Вологодской губерниях. Это указывает на то, что предки носительницы фамилии были, скорее всего, свободными крестьянами или ремесленниками, а не дворянами: фамилии на «-унов» редко встречаются в высших сословиях, где предпочитали модели на «-ский» или «-ов» от полных христианских имён.

Важно не путать эту фамилию со Смородиновыми или Сморчковыми — корень «сморг» не имеет отношения к ягодам или грибам. Это чисто глагольное образование, и в этом её словообразовательная уникальность: среди сотен фамилий на «-унов» (Хрипунов, Шептунов, Зевунов) Сморгунов выделяется редкой основой, не связанной ни с животным миром, ни с ремеслом, а с чисто человеческой привычкой или чертой внешности.