Фамилия Смыкун — редкий пример, где прозвище образовано от глагола, но не от очевидного. В основе лежит южнорусское или украинское слово «смыкать» — в переносном смысле «смыкать глаза», то есть спать, дремать. Соответственно, Смыкун — это «соня», любитель поспать. Версия звучит необидно, скорее бытовой прозвищной характеристикой, каких много в старых русских фамилиях: Неспи, Дремов, Сонин.

Суффикс -ун в русской ономастике типичен для прозвищ, обозначающих склонность к действию: говорун, ворчун, молчун. Смыкун стоит в том же ряду — человек, который постоянно «смыкает», то есть дремлет. Возможна и вторая, более редкая версия: от «смыкать» в значении «закрывать, соединять» — например, если человек отвечал за запирание ворот или сундуков. Но она менее вероятна: для обозначения сторожа или замочника существовали другие, более конкретные прозвища (Замочников, Сторожев).

Географически фамилия тяготеет к западным и южным областям России, а также к Украине и Беларуси — там глагол «смыкати» в значении «спать» был в ходу в диалектной речи. В центральных и северных регионах России Смыкун встречается редко, почти как единичные случаи.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Смыков, Смычков — показывает, что Смыкун стоит особняком. Смыков чаще связывают с музыкальным инструментом (смычок), а Смыкун — чисто глагольное прозвище, без предметной основы. Это делает фамилию более «живой»: она не от вещи, а от действия, от привычки.

В сословном плане Смыкун, скорее всего, крестьянская или казацкая фамилия. В дворянских родословных книгах она не зафиксирована, что типично для прозвищ бытового характера. Известных носителей с этой фамилией в истории не прослеживается, но в современных телефонных справочниках и базах данных она встречается — единично, но устойчиво.