Фамилия Собакинова — женская форма от Собакинов, и первое, что бросается в глаза, — это необычный суффикс. В русских фамилиях чаще встречаются -ов/-ев и -ин. Модель на -инов, хоть и не уникальна, встречается реже. Она указывает на двойное патронимическое происхождение: сначала от прозвища или имени образовали основу на -ин (Собакин — «сын Собаки»), а затем к ней добавили ещё один суффикс принадлежности -ов. Проще говоря, Собакинов — это «внук» или «потомок» того, кого звали Собакиным. Такая форма могла закрепиться в северных или сибирских говорах, где любили усложнять фамилии.

Корень «собак-» в основе прозвища. Прямого отношения к животному могло и не быть: в старых русских говорах «собакой» называли не только пса, но и цепкого, злого, сварливого человека, а также навязчивого попрошайку или торговца-перекупщика. В псковских и тверских диалектах слово «собака» означало «репей» — из-за колючек, которые цепляются к одежде. Так могли прозвать настырного, цепкого человека. Встречается и другая версия: в некоторых областях «собака» — это вид рыболовной снасти или деревянный крюк для подвешивания котла. Прозвище мог получить мастер, делавший такие крюки.

Однозначно определить, что легло в основу фамилии, без родословной конкретной семьи невозможно. Но если отбросить маловероятное (прямое сравнение с животным как с ругательством), то наиболее правдоподобны две версии: прозвище по характеру («репей», «цепкий человек») или по профессии (рыбак или кузнец, работавший с крюками). В любом случае, Собакиновы — не потомки «собаки», а потомки человека, которого за какие-то черты или занятия так прозвали в миру.

Географически фамилия встречается рассеянно, но чаще в центральных и северных областях России, а также на Урале. В документах XVII–XVIII веков попадаются крестьяне и посадские люди с этой фамилией, что говорит о её простонародном происхождении. Дворянских родов Собакиновых в истории не зафиксировано.