Фамилия Стафидов — редкий случай в русской ономастике, когда именование возникло не от прозвища или профессии, а от церковного слова «стафиды», то есть сушёный виноград, изюм. Это искусственное по происхождению образование, и таких фамилий в русском языке немного.

Основа фамилии напрямую связана с православной традицией. Виноград освящают и употребляют в пищу в праздник Преображения Господня, а виноградное вино используют при совершении таинств. В «Настольной книге для священно-церковнослужителей» на основании книг Бытие и Второзаконие указывается, что Спаситель на Тайной вечере употреблял именно красное виноградное вино, которое в Писании называется «кровью гроздовой». Отсюда и требования к церковному вину: оно должно быть виноградным, чистым, красным и не обязательно сладким. Густота окраски важна потому, что при совершении таинства вино разбавляют водой, но цвет должен оставаться красным.

Интересна и словообразовательная модель. Суффикс -ов в русском языке обычно присоединяется к основам мужского рода, однако здесь он закрепился за словом женского рода «стафида» во множественном числе. Аналогичный пример — фамилия Розов, образованная от нарицательного «роза», а не «Розин», как можно было бы ожидать по строгим грамматическим правилам. Это говорит о том, что при создании таких искусственных фамилий (а они часто появлялись в семинаристской среде) руководствовались не столько языковой нормой, сколько благозвучием и логикой церковного обихода.

Вероятнее всего, фамилия Стафидов возникла в среде духовенства. Подобные именования давали выпускникам семинарий, когда при поступлении или окончании учебного заведения им присваивали новую фамилию вместо бытовой или «мирской». Выбор основы часто диктовался церковным календарём, символикой или просто книжной эрудицией наставников. Слово «стафиды» — книжное, церковнославянское, в живой народной речи его употребляли редко, что дополнительно подтверждает искусственное происхождение фамилии.

Если искать аналоги, то в том же ряду стоят фамилии Виноградов, Изюмов, Розов — все они либо семинарские, либо образованы от названий растений и плодов, имеющих символическое значение в христианстве. Но Стафидов выделяется даже на их фоне: основа взята не от привычного «виноград», а от менее употребительного «стафиды», что делает фамилию более книжной и редкой.

Точных сведений о географии распространения фамилии мало, как и данных о конкретных известных носителях. Это ожидаемо: искусственные фамилии духовенства часто оставались локальными и не получали широкого распространения. Но сам факт её существования — замечательный памятник русской культуры, сохранивший след церковной лексики и традиций в повседневном именовании.