Фамилия Стафин — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. Чтобы понять её корень, нужно отбросить привычную модель «отчество от крестильного имени» и присмотреться к суффиксу. В фамилии Стафин суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Стафин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Стафа. А вот что такое «Стафа» — главный вопрос.

Самая прямая версия: Стафа — это форма канонического имени Евстафий (в просторечии — Евстафий, Остафий, Стахей). В русских говорах имя легко ужималось: Евстафий → Стафей → Стафа. Если так, то Стафин — типичное русское отчество от обиходной формы имени, означающего «устойчивый, крепко стоящий» (от греч. eustathēs). Носитель фамилии — потомок человека по имени Стафа (Евстафий). Такое сокращение встречается нечасто, что и делает фамилию редкой.

Вторая версия, менее вероятная, но не исключённая: прозвище Стафа могло возникнуть от диалектного глагола «стафить» — в некоторых говорах это значит «упрямиться, капризничать» или «медлить, возиться». Тогда прозвище дали человеку с соответствующим характером. Однако для фамилий на -ин основа от глагола — случай нетипичный, обычно так образуются фамилии от имён или прозвищ-существительных, поэтому версия с Евстафием надёжнее.

Географически фамилия Стафин встречается рассеянно, без явного гнезда в одном регионе, что характерно для фамилий, возникших от редкой формы имени. В отличие от массовых Ивановых или Петровых, Стафины — штучный товар в русской ономастике. По сословной принадлежности предки могли быть и крестьянами, и мещанами — фамилия не даёт подсказок о социальном статусе, так как образована по общей модели.

Коротко: Стафин — это «сын Стафы», а Стафа — народная форма имени Евстафий. Фамилия стоит в ряду таких же усечённых отчеств, как Стахов, Стахеев, и выделяется именно редкостью исходной формы.