Фамилия Стародубкина — женская форма фамилии Стародубкин, и её разбор стоит начать с географической привязки. Основа здесь — «Стародуб», а суффикс «-кин» указывает на принадлежность: буквально «сын или потомок человека из Стародуба». В отличие от более частых фамилий на «-ов» и «-ев», модель на «-ин» в русской ономастике обычно образуется от основ на «-а» или «-я» (например, Пушкин — от Пушка, Стародубкин — от Стародуба). Но здесь «Стародуб» — это не имя, а топоним.

Стародуб — древний русский город (ныне в Брянской области), известный с XI века. Его название прозрачно: «старый дуб» — либо в прямом смысле (вековое дерево как ориентир), либо как метафора крепости и древности. Фамилия Стародубкин, таким образом, — типичная «топонимическая» фамилия: её давали переселенцам, которые переехали из Стародуба в другую местность. В XVI–XVII веках, когда шло активное заселение южных и восточных земель, такие фамилии были удобны для учёта: «Ивашка Стародубец» или «Петруха Стародубкин» — и сразу ясно, откуда человек.

Важный нюанс: окончание «-кина» (а не «-ина») говорит о том, что основа «Стародуб» при образовании фамилии получила уменьшительный или патронимический суффикс «-к-». То есть сначала возникло прозвище Стародубка (житель Стародуба), а от него уже — Стародубкин. Это отличает фамилию от, скажем, Стародубова, где суффикс «-ов» присоединён напрямую к топониму. Такая модель с «-к-» встречается реже и часто указывает на более разговорное, бытовое происхождение прозвища — не «официальный» выходец, а «стародубка», свой, местный.

Спорных версий у фамилии почти нет. Иногда пытаются связать её с прозвищем Старый Дуб (человек крепкий, старый), но против этого говорит типичная для топонимических фамилий география: Стародубкины встречаются в основном в областях, куда шла миграция из центральной России — в Поволжье, на Урале, в Сибири. Если бы корень был в прозвище, фамилия была бы более равномерно распределена по стране. Поэтому версия с городом Стародубом — основная и наиболее правдоподобная.

В сословном плане Стародубкины, скорее всего, были крестьянами или мещанами. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, хотя отдельные купцы могли её носить. Для человека, ищущего свои корни, это подсказка: стоит смотреть в сторону выходцев из Стародубского уезда (Черниговской, позже Брянской губернии), а также в документы о переселении крестьян в XVIII–XIX веках.