Фамилия Стебунов образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Стебунов образована от прозвища Стебун, восходящего к глаголу «стебать» - «хлестать». Прозвище упоминается в XV веке: Сенка Стебан, крестьянин, 1495; Стебан Семенов, крестьянин, 1495, Новгород. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Стебун, со временем получил фамилию Стебунов. О точном месте и времени возникновения фамилии Стебунов в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Стебунов представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.