Фамилия Стоилкова — наглядный пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. Форма на -ов/-ев указывает на притяжательное значение: «чей?» — «Стоилков», то есть потомок человека по имени или прозвищу Стоилко. Это типичная модель для восточнославянских фамилий, особенно распространённая в Болгарии и среди болгарских переселенцев на юге России, в Бессарабии и на Украине.

Основа Стоил- восходит к личному имени Стоил — краткой форме от Стоило или Стоян. В болгарской и македонской ономастике эти имена связаны с глаголом «стоя» и означают «стойкий», «устойчивый», «постоянный». Вероятно, так называли ребёнка, которого хотели видеть крепким и надёжным, или же давали имя-оберег, чтобы он «устоял» перед болезнями и бедами. Болгарский исследователь Стефан Илчев в своём «Речник на личните и фамилни имена у българите» относит Стоил к группе имён-пожеланий, популярных в эпоху Второго Болгарского царства.

Суффикс -к- в основе Стоилко — это уменьшительно-ласкательный или обиходный формант, характерный для болгарских и украинских имён. Он превращает полное имя в семейно-бытовое, которое затем закрепляется за родом. Женская форма Стоилкова, таким образом, изначально означала «жена или дочь Стоилко», но со временем стала родовой фамилией, передаваемой по наследству.

Географически фамилия Стоилкова чаще всего встречается в Болгарии (особенно в южных и восточных областях), а также среди болгарских диаспор в Молдове, Одесской области Украины и в южных регионах России. В русском контексте она сохраняет южнославянский колорит и не смешивается с исконно русскими фамилиями на -ов, поскольку её основа нехарактерна для русской антропонимии. Если ваш предок носил эту фамилию, с высокой вероятностью он был болгарином или потомком болгарских переселенцев, а его родовое имя восходит к простому и твёрдому пожеланию — быть стойким.